Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD4Q13485 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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