Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNTB2Q13425 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms