Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMS2P3Q13401 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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