Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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