Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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