Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP140Q13342 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SP140Q13342 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SP140Q13342 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP140Q13342 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP140Q13342 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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