Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ERCC8Q13216 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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ERCC8Q13216 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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