Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
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