Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NR1H3Q13133 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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