Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM2Q13029 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
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