Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BNIP1Q12981 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms