Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CNTN1Q12860 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CNTN1Q12860 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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