Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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FOXO1Q12778 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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FOXO1Q12778 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FOXO1Q12778 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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FOXO1Q12778 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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