Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNB2Q08289 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms