Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNDQ07001 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms