Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LTBQ06643 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTBQ06643 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBQ06643 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBQ06643 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBQ06643 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBQ06643 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBQ06643 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTBQ06643 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms