Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSPL2Q05D32 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms