Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACVR1Q04771 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACVR1Q04771 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms