Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms