Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OCA2Q04671 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OCA2Q04671 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms