Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms