Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms