Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OC90Q02509 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OC90Q02509 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OC90Q02509 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OC90Q02509 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OC90Q02509 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OC90Q02509 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms