Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms