Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms