Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK3Q00526 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK3Q00526 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms