Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms