Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIPPLY3P57055 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3P57055 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms