Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP7P55210 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP7P55210 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP7P55210 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP7P55210 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP7P55210 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP7P55210 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP7P55210 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP7P55210 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP7P55210 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP7P55210 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP7P55210 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms