Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AQP4P55087 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AQP4P55087 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AQP4P55087 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AQP4P55087 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AQP4P55087 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AQP4P55087 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AQP4P55087 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AQP4P55087 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AQP4P55087 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AQP4P55087 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AQP4P55087 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms