Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms