Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms