Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6CP51160 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms