Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSK3BP49841 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms