Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms