Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NESP48681 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NESP48681 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NESP48681 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NESP48681 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NESP48681 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NESP48681 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms