Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCLMP48507 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCLMP48507 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCLMP48507 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCLMP48507 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCLMP48507 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCLMP48507 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms