Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms