Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSFMP43897 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSFMP43897 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TSFMP43897 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSFMP43897 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSFMP43897 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSFMP43897 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms