Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFMP43652 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFMP43652 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFMP43652 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AFMP43652 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AFMP43652 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms