Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms