Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms