Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCKARP32238 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms