Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms