Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD34P28906 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD34P28906 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD34P28906 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD34P28906 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD34P28906 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD34P28906 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms