Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRBP28702 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRBP28702 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRBP28702 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRBP28702 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRBP28702 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRBP28702 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRBP28702 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRBP28702 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRBP28702 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRBP28702 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms