Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms