Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMY2BP19961 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms