Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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