Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATF1P18846 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATF1P18846 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATF1P18846 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATF1P18846 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATF1P18846 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATF1P18846 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATF1P18846 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATF1P18846 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms